Tıp eğitini İstanbul Üniversitesi Çapa Tıp Fakültesi'nde, uzmanlık eğitimini 19 Mayıs Üniversitesi Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı’nda tamamladı.
Aynı kurumda uzman, yardımcı doçent ve doçent kadrolarında çalıştı.
Askerlik görevini Gülhane Askeri Tıp Akademisi Ankara Hastanesi Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Kliniği'nde tamamladı.
Halen Samsun Atakum'da kendi özel muayenehanesinde hasta kabul etmektedir.
Temel ilgi ve hizmet alanları; çocukların fiziksel, zihinsel ve sosyal olarak gelişimlerinin desteklenmesi, çocuklarda dil gelişimi, dikkat, zekâ ve odaklanma becerilerinin geliştirilmesi, çocukluk çağı beslenmesi, tamamlayıcı beslenme (ek gıda), iştahsızlık, dikkat, öğrenme ve davranış problemleri, konuşma gecikmesi, uyku sorunları, üstün potansiyelli çocuklar ve okuma güçlüğü (disleksi) başta olmak üzere özel öğrenme güçlüğüdür.
Doç. Dr. M. Şükrü PAKSU aynı zamanda çocukların zihinsel, fiziksel ve ruhsal yönden gelişimlerini destekleyici programlar konusunda çalışmalar yapan, oyun ve eğitici materyaller geliştiren ve bu alanlarda bireysel ve grup şeklinde hizmetler sunan Beceri Kazanım Merkezi (BEKAM) ve BEKAM Wellness Çocuk Cimnastik Yoga Merkezlerinin kurucusudur.
